2019年5月8日,中国科学院、浙江省人民政府签署医学合作框架协议,确定合作共建中国科学院基础医学与肿瘤研究所。这是中国科学院首个以医学命名的直属研究机构,也是浙江省重点引进和打造的生命健康科创高地主平台。2023年2月23日,中编办正式批复设立中国科学院杭州医学研究所为中国科学院直属事业单位。
中国科学院杭州医学研究所面向人民生命健康,围绕“四个率先”和“两加快一努力”目标要求,建设生命健康科创高地主平台和国家医学领域科技战略力量主力军,为“健康中国”和国家长远发展提供科学基础和关键核心技术支撑。